Déposée le 19/09/11

Recrutement d'un Ingénieur (H/F) d'Etude

Contrat : CDD de 12 mois à partir novembre 2011

Mission : La mission (d'une durée de 12 mois) du (de la) candidat(e) recruté(e) sera de développer des méthodes d’investigation associées à la caractérisation biochimique et moléculaire des voies de synthèse des acides gras à longue chaîne de la série oméga-3, chez différentes micro-algues marines soumises à un stress thermique.
Le travail principal portera sur l’étude de la régulation des activités de désaturation chez différents modèles de micro-algues marines riches en EPA et/ou DHA et, ceci à travers une approche métabolique et moléculaire. Différentes microalgues marines telles que des diatomées (P. tricornutum, O. aurita) ou des haptophycées (P. lutheri) seront soumises à un stress thermique de quelques heures afin d’étudier leur réponse à un niveau biochimique et moléculaire. Les marqueurs biologiques suivis seront des activités enzymatiques associées soit au métabolisme lipidique (désaturation/élongation) soit à un stress (catalase, SOD, peroxydase).
Deux approches seront menées in vitro à partir de cultures de micro-algues axéniques cultivées sous différentes conditions de température.
- L’exploration des voies de synthèse des AGPI-LC de la série des oméga-3 de différentes micro-algues marines riches en EPA et/ou en DHA sera réalisée par la caractérisation des différents lipides après fractionnement cellulaire ainsi qu’en étudiant l’influence de la température sur les teneurs en lipides et en acides gras des micro-algues. De plus, la caractérisation moléculaire des enzymes impliquées dans les voies de synthèse des AGPI-LC sera effectuée.
- La réponse au stress thermique sera menée par mesure d’activités enzymatiques mais aussi par étude de l’expression des gènes des enzymes associées à différents mécanismes de défense en relation avec ce stress.
Méthodologies à mettre en oeuvre:
- Régulation par des facteurs environnementaux (température) de la synthèse des AGPI-LC. Détermination des teneurs en acides gras dans les principales classes de lipides des micro-algues.
- Détermination, par l’utilisation de substrats radiomarqués, des activités de désaturation et d’élongation impliquées dans la synthèse des AGPI-LC de la série
oméga-3. Dosage par spectrophotométrie des activités des enzymes du stress (catalase, SOD, peroxydase)
- Caractérisation moléculaire des désaturases et/ou élongases impliquées dans la synthèse des AGPI-LC de la série oméga-3.
- Expression des gènes des enzymes en réponse à un stress.

Compétences attendues / souhaitées:
Biochimie métabolique : bonne connaissance du métabolisme carboné
Biologie moléculaire: extractions d’ADN et d’ARN, PCR, clonage
Extraction et séparation des lipides
Mesures d’activités enzymatiques par spectrophotométrie
Techniques chromatographiques : HPLC, CPG, CPG/SM
Culture de microalgues en milieu contrôlé
Mobilité géographique

Candidature : Transmettre les candidatures avant le 14 octobre 2011 (CV + lettre de motivation) aux deux adresses suivantes:
Dr Virginie MIMOUNI: vmimouni@univ-lemans.fr
Dr Lionel ULMANN: lulman@univ-lemans.fr



Déposée le 23/06/11

Recrutement d'un Ingénieur (H/F) d'Etude en techniques Biologiques

Contrat : CDD de 12 mois à partir octobre 2011

Mission : l'ingénieur recruté aura deux missions principales, une relevant du domaine de la biologie moléculaire et une de la biologie cellulaire.
Biologie moléculaire :
Dans ce projet, il sera en charge de l'élaboration de constructions génétiques au STLO. Différents plasmides navettes seront construits dans la bactérie modèle Escherichia coli puis transférés dans différentes souches de Propionibacterium freudenreichii. Les différentes constructions seront vérifiées par séquençage. L'expression et la sécrétion de différentes protéines chimères seront ensuite vérifiées par une approche protéomique, électrophorèse et western blot.
Biologie cellulaire :
Les différentes souches recombinantes de Propionibacterium freudenreichii seront testées de la façon suivante. Des surnageants bactériens seront préparés et utilisés pour traiter des cellules d'adénocarcinome colique humain. Ces traitements seront comparés à TRAIL seul et à Propionibacterium freudenreichii non-recombinante. Les cellules ainsi traitées seront ensuite analysées par une démarche pratiquée en routine à SeRAIC pour l'analyse des voies d'induction de la mort cellulaire. Les ARNm cellulaires seront extraits pour une analyse transcriptomique sur puce pangénomique.

Activités principales :
Conduire, en adaptant les conditions expérimentales, un ensemble de techniques (microbiologie, électrophorèse, clonage, séquençage, PCR, culture cellulaire, protéomique).
Exploiter et présenter les résultats des analyses, en garantir la qualité.
Rédiger des rapports d'expérience ou d'étude, des notes techniques

Niveau d'études : Master 2 recherche ou professionnel

Compétences requises :
Une expertise en microbiologie est requise, avec une compétence particulière en biologie moléculaire procaryote. Une expérience du clonage est particulièrement souhaitée. Un savoir faire de base en électrophorèse et western blot serait apprécié.
La capacité au travail en équipe est un pré-requis majeur.
Les compétences en culture cellulaire seront aisément acquises au contact du personnel de l'équipe SeRAIC.

Contacts :
Marie-Thérèse DIMANCHE-BOITREL - 02 23 23 48 99 / marie-therese.boitrel@univ-rennes1.fr
EA SeRAIC, faculté de Pharmacie, 2 avenue du Professeur Léon Bernard, 35043 Rennes cedex
Gwénaël JAN - Tel 02 23 48 57 41 / gwenael.jan@rennes.inra.fr
UMR1253 STLO, INRA/Agrocampus Ouest, 65 rue de Saint Brieuc, 35042 Rennes Cedex